白血病细胞整体遗传相互作用网络首次绘出

众所周知，癌症是一种异质性的疾病，有许多不同的亚型。这些癌症依赖不同的通路来存活，对癌症治疗药物也有着不同的反应。对研究人员来说，挑战在于如何精确定义这些不同的通路，并找到脆弱之处，以此作为药物治疗的靶点。

近日，美国Whitehead研究所和Broad研究所的研究人员在这方面迈出了重要一步：他们成功鉴定出14种人类急性髓性白血病（AML）细胞系中的一组关键基因，它们是细胞增殖和存活所必需的。将这份“基因必要性图谱”与现有的基因组信息相结合，此研究将有助于新疗法的开发。这项研究成果于2月2日发表在《Cell》杂志上。

在这项研究中，研究人员将重点放在与Ras癌基因相关联的基因和蛋白通路上。Ras基因是人类癌症中经常发生突变的癌基因，在急性髓性白血病及其他癌症中发挥重要作用。

这篇论文的第一作者，Whitehead研究所和Broad研究所的研究生Tim Wang表示：“在大多数情况下，Ras蛋白的突变体都被认为是‘无药可靶向的（undruggable）’。不过，替代方法是找到Ras突变癌症依赖的其他基因，希望其中的一个能够成为药物靶点。不幸的是，这种‘Ras合成致死’基因目前仍难以确定。”

于是，研究人员利用基于CRISPR的遗传筛查技术，全面评估18,000个蛋白编码基因对人类基因组的影响。这些数据的分析以及后续工作揭示了之前未研究的基因的分子功能，鉴定出与Ras突变体的致死相互作用。这篇论文的资深作者、麻省理工学院的David Sabatini表示：“这个过程能够让我们鉴定出Ras突变细胞所必需的基因列表。”

同时，研究人员也关注了一些基因，它们在某些细胞系中必不可少，而在其他细胞系中可有可无。对于每一个基因，研究人员通过数据筛选，找到必要性模式匹配的其他基因，认为它们有着类似的功能。事实上，这种分析揭示了共同作用的基因组合，并发现了之前未知或未研究过的基因关联。（生物通 薄荷）